{rfName}
A

Indexat a

Citacions

10

Altmetrics

Anàlisi d'autories institucional

Alemany-Fornes, MarcAutor o coautor

Compartir

8 demaig de 2023
Publicacions
>
Article
No

A crowdsourcing semi-automatic image segmentation platform for cell biology

Publicat a: Computers In Biology And Medicine. 130 104204- - 2021-01-09 130(), DOI: 10.1016/j.compbiomed.2020.104204

Autors:

Bafti, Saber Mirzaee; Ang, Chee Siang; Hossain, Md Moinul; Marcelli, Gianluca; Alemany-Fornes, Marc; Tsaousis, Anastasios D
[+]

Afiliacions

Univ Kent, Sch Biosci, RAPID Grp, Lab Mol & Evolutionary Parasitol, Canterbury CT2 7NJ, Kent, England - Autor o coautor
Univ Kent, Sch Engn & Digital Arts, Canterbury CT2 7NZ, Kent, England - Autor o coautor

Resum

State-of-the-art computer-vision algorithms rely on big and accurately annotated data, which are expensive, laborious and time-consuming to generate. This task is even more challenging when it comes to microbiological images, because they require specialized expertise for accurate annotation. Previous studies show that crowd sourcing and assistive-annotation tools are two potential solutions to address this challenge. In this work, we have developed a web-based platform to enable crowdsourcing annotation of image data; the platform is powered by a semi-automated assistive tool to support non-expert annotators to improve the annotation efficiency. The behavior of annotators with and without the assistive tool is analyzed, using biological images of different complexity. More specifically, non-experts have been asked to use the platform to annotate microbiological images of gut parasites, which are compared with annotations by experts. A quantitative evaluation is carried out on the results, confirming that the assistive tools can noticeably decrease the non-expert annotation's cost (time, click, interaction, etc.) while preserving or even improving the annotation's quality. The annotation quality of non-experts has been investigated using IoU (intersection over union), precision and recall; based on this analysis we propose some ideas on how to better design similar crowdsourcing and assistive platforms.
[+]

Paraules clau

AlgorithmsComputational biologyCrowdsourcingImage annotationInstance segmentationObject detectionSemi-auto segmentation

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2021, es trobava a la posició 6/57, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Mathematical & Computational Biology. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Independentment de l'impacte esperat determinat pel canal de difusió, és important destacar l'impacte real observat de la pròpia aportació.

Segons les diferents agències d'indexació, el nombre de citacions acumulades per aquesta publicació fins a la data 2026-04-03:

  • WoS: 3
[+]

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2026-04-03:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 33.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 33 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 11.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 13 (Altmetric).
[+]

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: United Kingdom.

[+]