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Análisis de autorías institucional

Arola Ferrer, Luis MariaAutor o CoautorSalvadó Rovira, Maria JosepaAutor o CoautorBladé Segarra, Maria CintaAutor o CoautorFernández Larrea, Juan BautistaAutor o CoautorPujadas Anguiano, GerardAutor o CoautorBlay Olivé, Maria TeresaAutor o CoautorVaque Marques, MontserratAutor o CoautorArdèvol Grau, AnnaAutor o CoautorFernández-Larrea JAutor o CoautorArola LAutor o Coautor

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Review

Protein-ligand docking: A review of recent advances and future perspectives

Publicado en:Current Pharmaceutical Analysis. 4 (1): 1-19 - 2008-02-01 4(1), DOI: 10.2174/157341208783497597

Autores: Vaque, Montserrat; Ardrevol, Anna; Blade, Cinta; Salvado, M Josepa; Blay, Mayte; Fernandez-Larrea, Juan; Arola, Lluis; Pujadas, Gerard

Afiliaciones

Univ Rovira & Virgili, Dept Bioquim & Biotecnol, Tarragona 43007, Catalonia, Spain - Autor o Coautor
Universitat Rovira i Virgili - Autor o Coautor

Resumen

Understanding the interactions between proteins and ligands is crucial for the pharmaceutical and functional food industries. The experimental structures of these protein/ligand complexes are usually obtained, under highly expert control, by time-consuming techniques such as X-ray crystallography or NMR. These techniques are therefore not suitable for routinely screening the possible interaction between one receptor and thousands of ligands. To overcome this limitation, computational algorithms (i.e. docking algorithms) have been developed that use the individual structures of the receptor and ligand to predict the structure of their complex. The present review, then, summarizes: (a) the fundamentals of the algorithms of the most commontly used docking programmes (with particular emphasis on their strengths and limitations); (b) how the results from different docking algorithms compare (i.e. which software gives the best predictions); and (c) the future perspectives and challenges for docking techniques. © 2008 Bentham Science Publishers Ltd.

Palabras clave

Accommodating receptor flexibilityAutodockAutomated dockingBinding-sitesDrug designEfficient molecular dockingEhitsEmpirical scoring functionsFlexible ligandsGlideGoldHomology modelsIncremental construction algorithmMolegro virtual dockerSide-chain flexibility

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Current Pharmaceutical Analysis debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia Scopus (SJR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2008, se encontraba en la posición , consiguiendo con ello situarse como revista Q2 (Segundo Cuartil), en la categoría Pharmaceutical Science. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada en el Cuartil Q4 para la agencia WoS (JCR) en la categoría Pharmacology & Pharmacy.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions, arroja un valor de: 7.39, lo que indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: Dimensions Jun 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-06-28, el siguiente número de citas:

  • WoS: 70
  • Scopus: 84

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-06-28:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 145.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 144 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 3.
  • El número de menciones en Wikipedia: 1 (Altmetric).

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Vaqué M) y Último Autor (Pujadas G).

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido Pujadas G.